Skip to main content

Table 2 Gene table for 84 genes of DNA damage signaling pathway PCR array

From: Rad1 attenuates DNA double-strand breaks and cell cycle arrest in type II alveolar epithelial cells of rats with bronchopulmonary dysplasia

ATM / ATR Signaling

ATM, Bard1, Brca1, Cdc25a, Chek1, Chek2 (Rad53), Csnk2a2, Fancd2, Hus1, Parp1 (Adprt1), Parp2,Rad1, Rad17, Rad50, Rad9, Rnf8, Smc1a (Smc1l1), Topbp1, Tp53 (p53)

DNA Damage & Repair

Nucleotide Excision Repair (NER): Brca2, Ddb2, Dclre1a, Ercc1, Ercc2 (Xpd), Fancc, Lig1, Nthl1, Ogg1,Pcna, Pold3, Pole, Rpa1, Sirt1, Tp53 (p53), Xpc

Base Excision Repair (BER):

Apex1, Fen1, Lig1, Mbd4, Mpg, Nthl1, Ogg1, Parp1 (Adprt1), Parp2, Pcna,Pole, Tp53 (p53), Ung, Xrcc1, Wrn

Mismatch Repair (MMR):

Abl1, Exo1, Mlh1, Mlh3, Msh2, Msh3, Pcna, Pms1, Pms2

Double-Strand Break (DSB) Repair:

Atm, Blm, Brca1, Brca2, Chek1, Hus1, Lig1, Mlh1, Mre11a, Nbn (Nbs1), Prkdc, Rad50, Rad51, Rad52, Rpa1, Tp53bp1, Xrcc2, Xrcc6 (G22p1)

Other DNA Repair Genes:

Atrx, Bard1, Chek2 (Rad53), Fanca, Fancd2, Fancg, Gadd45a, Gadd45g, Mgmt (Agt),Polh, Poli,

Pttg1, Rad1, Rad17, Rad18, Rad21, Rad51c, Rad51b, Rad9, Rev1, Rnf8, Smc1a, Smc3, Sumo1, Topbp1, Wrnip1

Apoptosis

Abl1, Atm, Bard1, Bax, Bbc3, Brca1, Cdkn1a (Cip1,Waf1), Chek2 (Rad53), Csnk2a2, Ppp1r15a (Gadd34),Prkdc, Rad21, Rad9, Sirt1, Terf1, Tp53 (p53)

Cell Cycle

Atm, Cdc25a, Cdc25c, Cdkn1a (Cip1,Waf1), Chek1, Chek2(Rad53), Ddit3 (Gadd153,Chop), Mif, Ppm1d (Wip1), Ppp1r15a (Gadd34), Terf1, Tp53 (p53)