Skip to main content

Table 2 Oligonucleotide primer sequences.

From: Identification of Genes Potentially Involved in the Increased Risk of Malignancy in NF1-Microdeleted Patients

Genes

Oligonucleotide

Sequence

PCR product size (bp)

LRRC37B2

Upper primer

5′-GCA GAA GTC AAG TGA GCT CAT GAA-3′

84

Lower primer

5′-ATG ACA GTC ACA GAT ATT GCG AAG AT-3′

 

CRLF3

Upper primer

5′-GAA TCA TCG GGT GTT CTC TAC TCC A-3′

83

Lower primer

5′-TGT CCC ACA GTT TCA ACT CTG AAT-3′

 

ATAD5

Upper primer

5′-GTT TGA TGG CTG CTT TGA AGA AA-3′

60

Lower primer

5′-CTG GCA ACA TTT AGC AGG GAA G-3′

 

C17orf42

Upper primer

5′-CTG AGA AAG CTC CTC AAA CCA GAC-3′

95

Lower primer

5′-CAG GCA ATT CTT CGA GTA CCA AA-3′

 

CENTA2

Upper primer

5′-CCC TCA ACC GGC TTA CTG CAT C-3′

86

Lower primer

5′-AGG TGT TCA GTG GCA GCC AGT TC-3′

 

RNF135

Upper primer

5′-TGC CTG ACC AGA GCC ACC C-3′

63

Lower primer

5′-GAT GGA TGG CCC ACT GAG CA-3′

 

LOC646021

Upper primer

5′-CAG AGG CCG GGA CAG TTT CT-3′

98

Lower primer

5′-TGT GAT CTC AGG TTT TGG ATA GGT T-3′

 

LOC646037

Upper primer

5′-TGA TGT TGG GCA CCT CAA CTC C-3′

65

Lower primer

5′-GGC TTT GGC AGG GGG TGA-3′

 

NF1

Upper primer

5′-ACA GAG CGT GGC CTA CTT AGC A-3′

166

Lower primer

5′-GGA CCA TGG CTG AGT CTC CTT T-3′

 

OMG

Upper primer

5′-TCC AGA CCA ATC TTT TGA CCA ACT-3′

123

Lower primer

5′-GCT TTT GTT TCC ATC ATC CAC TTC-3′

 

EVI2B

Upper primer

5′-CAG GAC GAC TAC GCT CGG CA-3′

90

Lower primer

5′-CAC CAC AGC GTC AGG GGC T-3′

 

EVI2A

Upper primer

5′-TGT CTC CTG GAA CAA AAG CAA ACT-3′

93

Lower primer

5′-GGT TTC TGC CTG TCT TGT TTT GAA-3′

 

RAB11FIP4

Upper primer

5′-AGC CTC AGC CTC TAC GAA GCA A-3′

111

Lower primer

5′-CTT CAG GGC TTC CAT TAG CTC ATC-3′

 

C17orf79

Upper primer

5′-TCA AGG GAA TCC ATA TGA TGC TGA-3′

72

Lower primer

5′-CAG CAC ACC CAA GGT TTA AGC TCT-3′

 

UTP6

Upper primer

5′-GGC TCC CGG AAT TGG AAC AG-3′

82

Lower primer

5′-TCG GAA GCC TTC TTA ATG ATA GCC T-3′

 

SUZ12

Upper primer

5′-TCG CAA CGG ACC AGT TAA GAG AA-3′

64

Lower primer

5′-TGT TCG TTT TGG CCT GCA CA-3′

 

LRRC37B

Upper primer

5′-CCG GCA TTA AAA TAT CTA GAC ATG-3′

87

Lower primer

5′-TTC CAG TTC AAC AGT CAT CGT GAG-3′

 

MKI67

Upper primer

5′-ATT GAA CCT GCG GAA GAG CTG A-3′

105

Lower primer

5′-GGA GCG CAG GGA TAT TCC CTT A-3′

 

TBP

Upper primer

5′-TGC ACA GGA GCC AAG AGT GAA-3′

132

Lower primer

5′-CAC ATC ACA GCT CCC CAC CA-3′

 

RPLP0

Upper primer

5′-GGC GAC CTG GAA GTC CAA CT-3′

149

Lower primer

5′-CCA TCA GCA CCA CAG CCT TC-3′